云南昆华医院重点专科：呼吸科、血液内科、内分泌代谢科、心血管内科、神经内科、肝胆外科、胸心外科、普外科、骨科、眼科、耳鼻喉科、生殖遗传科
云南第二人民医院云南省眼病防治中心、云南省口腔疾病防治中心、云南省创伤救治中心及云南省干部体检中心均设于此
云南省中医院现有的两个重点专科骨伤科、推拿科的病床也将各扩大到100张左右，医院的专科特色将更为突出
昆明医科大学第一附属医院拥有特色专科:皮肤科、心脏内科
昆明市第一人民医院神经外科（脑外科）、心内科、骨科，妇产科为市级重点学科
昆明市中医院肛肠痔瘘科、骨伤科、针灸科、急诊科为云南省重点学科；哮喘病云南省重点专病；皮肤科、男性病科、心理咨询科为院级特色专科
昆明市延安医院拥有省级两个重点学科：即心胸外科和妇产科；市级重点学科泌尿外科、心内科、肾内科；设有两个省级研究中心
西双版纳州人民医院热带传染病，心脏血管内外科，新生儿疾病，肝胆外科，泌尿外科，显微外科，颅脑和脊柱外科，妇科肿瘤和内分泌疾病，中医针灸等是医院重点学科
大理州人民医院有视力残疾康复中心、心血管疾病研究室、临床检验中心、创伤骨病研究室、牙病防治中心、糖尿病治疗教育中心、远程可视医疗会诊中心、医疗急救中心等
玉溪市人民医院医院将危急重症病人抢救、介入治疗、微创技术应用等作为医院发展的方向和重点
玉溪市中医院对治疗颈、腰椎间盘突出症、肩周炎、颈椎病、急慢性腰扭伤、中风后遗症、梨状肌综合征以及各种痛证、痿证、小儿营养不良等方面积累了丰富的临床经验
昆明总医院解放军昆明总医院是一所具有五十七年光荣历史的大型综合性医院
解放军第五十九医院创伤骨科中心、消化内镜中心、心血管疾病治疗中心、神经系统疾病介入治疗中心、肝病治疗中心等10余个特色中心

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