上海市肺科医院（上海市职业病医院）、同济大学附属上海市肺科医院创建于1933年，前身澄衷医院，是国立上海医学院（现复旦大学医学院）第二实习医院，著名的医学专家颜福庆、吴绍青等教授分别担任过医院院长。1998年上海市职业病医院整合到医院，现直属上海市卫生局领导，是以呼吸系统疾病诊治为特色的三级甲等专科医院。医院占地面积10.3万平方米，绿化面积达70%，院内溪水环绕于绿荫，亭阁相映于花丛，是上海市“花园单位”。
　　医院核定床位数825张，设有胸外、肿瘤、呼吸、心血管、结核及职业尘肺等14个临床科室，影像、检验等9个医技科室和针麻、肺癌免疫等8个实验室。同时，同济大学心肺血管分中心和复旦大学医学院呼吸病研究所二部设在医院。医院除开设有普通门诊、专家门诊外，还开设有特需门诊，同时，在本市延庆路还另设一门诊部，以满足广大病员的需求。
　　医院现有职工900余人，有硕士生导师8名，博士、硕士生51人，高级职称者69人。
　　医院拥有直线加速器、多排螺旋ct、dsa、核素扫描仪（ect）、片库式自动胸片机、电子支气管镜、电视胸腔镜、肺功能体容积仪、全自动微生物分析系统、全自动生化分析仪和彩色多普勒超声仪等大型先进的治疗和检查设备。
　　七十年来医院形成的主要专业特色是：肺部肿瘤、肺间质病、慢阻肺、哮喘、慢支、支扩、肺炎、肺源性心脏病、高血压、异常脂蛋白血症、冠心病、心肌病、肺结核、结节病、气胸、肺肉芽肿、纵隔疾病、职业中毒、尘肺及其它呼吸系统疑难杂症的内外科诊疗。医院面向全国，每年收治的门急诊和住院病人14多万人次，成功医治和抢救了数以万计的疑难危重病人。
　　医院胸外科技术力量雄厚，为上海市医学重点学科之一。建科五十多年来已施行各类手术近三万余例，开展了针刺麻醉、肺癌、气管隆突切除重建、运用镍钛记忆合金支架治疗气管狭窄。近几年，利用微创胸外科技术，开展胸腔镜进行各类肺切除手术和淋巴结清扫手术。肺减容术治疗慢阻肺等各类手术多为国内最先开展或居国内先进水平，多次获得国家科委、卫生部、市科委及市卫生局各类奖项。2004年还成功实施了亚洲首例老年人同种异体肺移植手术。其它科室在肺癌早期诊断、中晚期肺癌多学科治疗、肺科急重症救治、哮喘、慢性肺部阻塞性疾病治疗、呼吸衰竭抢救、冠心病内支架植入术、先天性心脏病封堵术、结核病及职业病尘肺、中毒的防治等方面具有本专业较高的水平。