1、南京脑科医院（原名南京神经精神病防治院），又名南京医科大学附属脑科医院。占地6.6万平方米,现有床位686张，全院固定资产金6878万元，医院设备总值4346万元，万元以上设备164台，高精尖设备有γ--刀、MR、DSA、计算机显微镜导航系统等。全院职工总数924人，其中卫技人员652人，高、中级职务者各82人和198人。医院有职能科室11个，临床专科9个，医技科室9个，其中重点科室3个。99年全年门诊量144921人次，收住院病人数4501人次。
　　该院始建于1947年，前身为卫生部南京精神病防治院，是我国第一所国立神经精神病专科医院。解放后更名为华东精神病防治院和南京神经精神病防治院。现名为南京脑科医院，南京医科大学附属脑科医院，隶属于南京市卫生局领导。
　　医院坚持以"科教兴院"作为医院发展的主体战略，承担了许多教学和科研任务。南京医科大学精神病学、神经病学、医学心理学三个教研室设在该院。医院承担南京地区三所高等医学院校和一所护校的教学和临床实习任务，还是卫生部精神医学、儿童精神医学培训基地，是省卫生厅神经内科、脑电图、脑立体定向与功能神经外科教学基地，多年来，为全国各地培训了专业技术人员2000余名。1991年和1993年国家教委先后确定我院为神经病学和精神卫生学硕士研究生学位点。南京神经精神病学研究所是1984年南京市人民政府批准设在南京脑科医院的神经精神病学研究机构，下设15个研究室。建所12年来，在翟书涛教授的主持下，开展神经精神病学的应用基础和临床研究，从94年承担国家、省、市级别及南京医科大学科研项目20项。"八五"以来共获科研成果42项，获省部级奖5项。
　　1999年，该院被卫生部、国家中医药管理局、中国人民解放军总后卫生部授予全国"百佳医院"称号，被卫生厅评为"十佳医院"。被省卫生厅、省中医药管理局、省人事厅授予"江苏省卫生系统先进集体"称号，被南京市卫生局授予"白求恩杯竞赛"第一名、"十佳医院"、"花园式医院"等。
　　2、南京脑科医院，始建于1947年，前身为卫生部南京精神病防治院，是我国第一所国立神经精神病专科医院。现为江苏省精神卫生指导中心，是江苏省唯一一所三级甲等神经精神病专科医院。占地面积6.6万平方米，建筑面积7万余平方米，拥有CT、MR、数字减影血管照影（DSA）、伽玛刀、神经导航系统、高压氧等大型设备，有床位650张，设有神经内科、神经外科、精神科、儿童精神科、老年精神科、医学心理科、康复科等10个临床科室和8个医技科室。医院为南京医科大学第二临床医学院二部，设有神经病学、精神病学、医学心理学3个教研室和6个研究机构，主要承担3所高等医学院校和1所卫校的神经病学、精神病学、医学心理学和护理学等专业课程的教学和临床实习带教任务。出版发行"神经病学杂志"、"精神病学杂志"和"神经外科医学杂志"三部医学专业期刊。九五"期间我院开展新技术、新项目28项，获各级课题62项，发表论文508篇，获各级科技奖39项。1999年，该院被卫生部等授予全国"百佳医院"称号，2000年被评为"全国卫生系统先进集体"、"江苏省十佳医院"等。